Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms