Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RabggtbP53612 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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