Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux1P53564 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux1P53564 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cux1P53564 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cux1P53564 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux1P53564 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux1P53564 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cux1P53564 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cux1P53564 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cux1P53564 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux1P53564 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms