Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efnb1P52795 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb1P52795 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms