Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HpdP49429 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HpdP49429 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HpdP49429 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HpdP49429 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HpdP49429 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HpdP49429 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HpdP49429 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HpdP49429 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HpdP49429 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HpdP49429 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HpdP49429 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HpdP49429 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HpdP49429 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HpdP49429 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HpdP49429 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HpdP49429 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HpdP49429 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HpdP49429 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HpdP49429 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HpdP49429 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HpdP49429 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HpdP49429 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HpdP49429 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HpdP49429 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HpdP49429 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HpdP49429 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HpdP49429 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HpdP49429 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HpdP49429 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HpdP49429 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HpdP49429 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HpdP49429 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HpdP49429 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HpdP49429 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HpdP49429 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HpdP49429 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HpdP49429 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HpdP49429 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HpdP49429 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HpdP49429 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HpdP49429 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HpdP49429 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HpdP49429 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HpdP49429 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HpdP49429 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HpdP49429 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HpdP49429 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HpdP49429 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HpdP49429 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HpdP49429 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HpdP49429 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HpdP49429 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HpdP49429 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HpdP49429 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms