Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrprbP47758 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrprbP47758 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrprbP47758 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrprbP47758 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrprbP47758 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrprbP47758 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SrprbP47758 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrprbP47758 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms