Protein–RNA interactions for Protein: P43276

Hist1h1b, Histone H1.5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h1bP43276 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist1h1bP43276 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist1h1bP43276 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms