Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms