Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd1P40201 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd1P40201 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chd1P40201 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chd1P40201 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chd1P40201 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chd1P40201 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd1P40201 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chd1P40201 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd1P40201 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms