Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rom1P32958 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rom1P32958 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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