Protein–RNA interactions for Protein: P32883

Kras, GTPase KRas, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KrasP32883 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KrasP32883 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KrasP32883 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KrasP32883 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KrasP32883 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KrasP32883 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KrasP32883 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KrasP32883 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KrasP32883 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KrasP32883 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KrasP32883 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KrasP32883 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KrasP32883 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KrasP32883 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KrasP32883 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KrasP32883 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KrasP32883 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KrasP32883 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KrasP32883 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KrasP32883 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KrasP32883 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KrasP32883 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KrasP32883 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KrasP32883 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KrasP32883 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KrasP32883 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KrasP32883 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KrasP32883 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KrasP32883 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms