Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif5cP28738 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif5cP28738 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms