Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RxraP28700 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxraP28700 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxraP28700 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxraP28700 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxraP28700 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxraP28700 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxraP28700 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxraP28700 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxraP28700 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxraP28700 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxraP28700 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxraP28700 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxraP28700 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxraP28700 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxraP28700 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxraP28700 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxraP28700 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxraP28700 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxraP28700 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxraP28700 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxraP28700 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxraP28700 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxraP28700 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxraP28700 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxraP28700 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxraP28700 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxraP28700 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RxraP28700 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxraP28700 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxraP28700 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxraP28700 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxraP28700 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RxraP28700 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxraP28700 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxraP28700 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxraP28700 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxraP28700 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxraP28700 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxraP28700 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxraP28700 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxraP28700 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxraP28700 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RxraP28700 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxraP28700 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxraP28700 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxraP28700 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RxraP28700 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RxraP28700 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxraP28700 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxraP28700 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxraP28700 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxraP28700 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxraP28700 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxraP28700 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxraP28700 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxraP28700 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxraP28700 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RxraP28700 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxraP28700 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxraP28700 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxraP28700 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxraP28700 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxraP28700 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxraP28700 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxraP28700 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxraP28700 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RxraP28700 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RxraP28700 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxraP28700 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxraP28700 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RxraP28700 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RxraP28700 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxraP28700 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxraP28700 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxraP28700 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxraP28700 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxraP28700 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxraP28700 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxraP28700 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxraP28700 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxraP28700 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxraP28700 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxraP28700 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxraP28700 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RxraP28700 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxraP28700 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxraP28700 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxraP28700 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RxraP28700 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxraP28700 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxraP28700 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxraP28700 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxraP28700 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxraP28700 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxraP28700 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxraP28700 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxraP28700 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxraP28700 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxraP28700 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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