Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CftrP26361 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CftrP26361 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CftrP26361 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CftrP26361 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CftrP26361 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CftrP26361 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CftrP26361 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CftrP26361 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CftrP26361 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CftrP26361 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CftrP26361 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CftrP26361 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CftrP26361 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CftrP26361 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CftrP26361 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CftrP26361 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CftrP26361 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CftrP26361 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CftrP26361 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CftrP26361 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CftrP26361 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CftrP26361 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CftrP26361 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CftrP26361 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CftrP26361 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CftrP26361 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CftrP26361 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CftrP26361 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CftrP26361 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CftrP26361 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CftrP26361 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CftrP26361 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CftrP26361 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CftrP26361 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CftrP26361 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CftrP26361 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CftrP26361 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CftrP26361 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CftrP26361 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CftrP26361 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CftrP26361 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CftrP26361 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CftrP26361 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CftrP26361 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CftrP26361 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CftrP26361 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CftrP26361 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CftrP26361 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CftrP26361 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CftrP26361 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CftrP26361 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CftrP26361 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CftrP26361 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CftrP26361 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CftrP26361 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CftrP26361 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CftrP26361 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CftrP26361 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CftrP26361 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CftrP26361 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CftrP26361 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CftrP26361 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CftrP26361 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CftrP26361 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CftrP26361 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CftrP26361 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CftrP26361 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CftrP26361 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CftrP26361 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CftrP26361 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CftrP26361 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CftrP26361 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CftrP26361 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CftrP26361 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CftrP26361 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CftrP26361 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CftrP26361 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CftrP26361 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CftrP26361 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CftrP26361 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CftrP26361 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CftrP26361 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CftrP26361 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CftrP26361 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CftrP26361 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CftrP26361 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CftrP26361 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CftrP26361 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CftrP26361 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CftrP26361 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CftrP26361 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CftrP26361 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CftrP26361 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CftrP26361 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CftrP26361 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CftrP26361 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CftrP26361 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CftrP26361 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CftrP26361 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms