Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChgaP26339 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChgaP26339 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChgaP26339 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ChgaP26339 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChgaP26339 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChgaP26339 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChgaP26339 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChgaP26339 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms