Protein–RNA interactions for Protein: P26039

Tln1, Talin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tln1P26039 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tln1P26039 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tln1P26039 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tln1P26039 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tln1P26039 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tln1P26039 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tln1P26039 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tln1P26039 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tln1P26039 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tln1P26039 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms