Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxd12P23812 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd12P23812 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms