Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkchP23298 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkchP23298 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkchP23298 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkchP23298 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkchP23298 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkchP23298 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkchP23298 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkchP23298 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkchP23298 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkchP23298 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkchP23298 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkchP23298 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkchP23298 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkchP23298 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkchP23298 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkchP23298 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkchP23298 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkchP23298 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkchP23298 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkchP23298 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms