Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Eif3aP23116 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3aP23116 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms