Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RargP18911 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RargP18911 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RargP18911 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RargP18911 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RargP18911 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RargP18911 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RargP18911 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RargP18911 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RargP18911 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RargP18911 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RargP18911 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RargP18911 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RargP18911 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RargP18911 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RargP18911 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RargP18911 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RargP18911 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RargP18911 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RargP18911 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RargP18911 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RargP18911 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RargP18911 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RargP18911 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RargP18911 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RargP18911 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RargP18911 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RargP18911 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RargP18911 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RargP18911 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RargP18911 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RargP18911 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RargP18911 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RargP18911 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RargP18911 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RargP18911 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RargP18911 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RargP18911 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RargP18911 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RargP18911 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RargP18911 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RargP18911 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RargP18911 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RargP18911 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RargP18911 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RargP18911 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RargP18911 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RargP18911 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RargP18911 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RargP18911 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RargP18911 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RargP18911 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RargP18911 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RargP18911 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RargP18911 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RargP18911 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RargP18911 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RargP18911 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RargP18911 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RargP18911 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RargP18911 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RargP18911 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RargP18911 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RargP18911 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RargP18911 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RargP18911 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RargP18911 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RargP18911 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RargP18911 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RargP18911 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RargP18911 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RargP18911 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RargP18911 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RargP18911 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RargP18911 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RargP18911 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RargP18911 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RargP18911 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RargP18911 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RargP18911 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RargP18911 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RargP18911 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms