Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpraP18052 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtpraP18052 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpraP18052 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtpraP18052 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpraP18052 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtpraP18052 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtpraP18052 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtpraP18052 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtpraP18052 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PtpraP18052 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtpraP18052 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtpraP18052 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtpraP18052 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtpraP18052 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtpraP18052 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtpraP18052 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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