Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptan1P16546 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms