Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD44P16070 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD44P16070 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD44P16070 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD44P16070 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD44P16070 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CD44P16070 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD44P16070 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD44P16070 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD44P16070 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD44P16070 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD44P16070 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD44P16070 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD44P16070 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD44P16070 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD44P16070 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD44P16070 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD44P16070 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD44P16070 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD44P16070 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD44P16070 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD44P16070 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD44P16070 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CD44P16070 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CD44P16070 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD44P16070 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD44P16070 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD44P16070 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD44P16070 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD44P16070 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD44P16070 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD44P16070 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CD44P16070 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD44P16070 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD44P16070 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD44P16070 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD44P16070 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD44P16070 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD44P16070 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD44P16070 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD44P16070 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD44P16070 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD44P16070 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD44P16070 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD44P16070 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD44P16070 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD44P16070 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD44P16070 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD44P16070 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD44P16070 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD44P16070 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD44P16070 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD44P16070 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD44P16070 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CD44P16070 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD44P16070 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD44P16070 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD44P16070 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CD44P16070 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD44P16070 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD44P16070 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD44P16070 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD44P16070 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD44P16070 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD44P16070 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD44P16070 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD44P16070 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD44P16070 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD44P16070 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD44P16070 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD44P16070 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD44P16070 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD44P16070 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD44P16070 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD44P16070 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CD44P16070 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD44P16070 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD44P16070 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD44P16070 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD44P16070 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD44P16070 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD44P16070 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms