Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkceP16054 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkceP16054 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkceP16054 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkceP16054 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkceP16054 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkceP16054 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkceP16054 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkceP16054 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms