Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SptbP15508 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SptbP15508 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SptbP15508 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SptbP15508 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SptbP15508 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SptbP15508 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SptbP15508 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SptbP15508 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SptbP15508 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SptbP15508 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SptbP15508 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SptbP15508 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SptbP15508 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SptbP15508 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SptbP15508 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SptbP15508 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SptbP15508 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SptbP15508 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SptbP15508 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SptbP15508 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SptbP15508 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SptbP15508 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SptbP15508 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SptbP15508 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SptbP15508 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SptbP15508 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SptbP15508 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SptbP15508 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SptbP15508 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SptbP15508 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SptbP15508 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SptbP15508 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SptbP15508 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SptbP15508 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SptbP15508 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SptbP15508 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SptbP15508 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SptbP15508 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SptbP15508 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SptbP15508 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SptbP15508 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SptbP15508 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SptbP15508 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SptbP15508 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SptbP15508 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SptbP15508 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SptbP15508 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SptbP15508 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SptbP15508 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SptbP15508 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SptbP15508 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SptbP15508 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SptbP15508 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SptbP15508 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SptbP15508 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SptbP15508 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SptbP15508 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SptbP15508 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SptbP15508 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SptbP15508 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SptbP15508 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SptbP15508 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SptbP15508 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SptbP15508 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SptbP15508 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SptbP15508 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SptbP15508 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SptbP15508 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SptbP15508 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SptbP15508 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SptbP15508 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SptbP15508 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SptbP15508 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SptbP15508 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SptbP15508 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SptbP15508 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SptbP15508 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SptbP15508 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SptbP15508 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SptbP15508 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms