Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp54P14576 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54P14576 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54P14576 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54P14576 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54P14576 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54P14576 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54P14576 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54P14576 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54P14576 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54P14576 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54P14576 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54P14576 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54P14576 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54P14576 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp54P14576 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54P14576 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54P14576 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54P14576 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms