Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms