Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spta1P08032 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spta1P08032 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spta1P08032 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spta1P08032 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spta1P08032 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spta1P08032 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spta1P08032 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spta1P08032 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spta1P08032 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spta1P08032 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spta1P08032 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms