Protein–RNA interactions for Protein: P06684

C5, Complement C5, mousemouse

Predictions only

Length 1,680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5P06684 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5P06684 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5P06684 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5P06684 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5P06684 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5P06684 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5P06684 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5P06684 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5P06684 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5P06684 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5P06684 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5P06684 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5P06684 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5P06684 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5P06684 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5P06684 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5P06684 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C5P06684 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5P06684 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C5P06684 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5P06684 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5P06684 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5P06684 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5P06684 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5P06684 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5P06684 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5P06684 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5P06684 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5P06684 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C5P06684 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5P06684 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5P06684 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5P06684 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5P06684 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5P06684 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C5P06684 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C5P06684 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C5P06684 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C5P06684 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C5P06684 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C5P06684 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C5P06684 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C5P06684 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C5P06684 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
C5P06684 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5P06684 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5P06684 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5P06684 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5P06684 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5P06684 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5P06684 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5P06684 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5P06684 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5P06684 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5P06684 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5P06684 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5P06684 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5P06684 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5P06684 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5P06684 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5P06684 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5P06684 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5P06684 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C5P06684 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C5P06684 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5P06684 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5P06684 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5P06684 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5P06684 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5P06684 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5P06684 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5P06684 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5P06684 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5P06684 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C5P06684 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5P06684 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5P06684 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5P06684 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5P06684 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5P06684 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5P06684 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5P06684 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5P06684 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5P06684 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5P06684 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5P06684 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C5P06684 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5P06684 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5P06684 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5P06684 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5P06684 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5P06684 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C5P06684 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5P06684 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5P06684 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5P06684 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5P06684 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5P06684 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5P06684 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5P06684 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms