Protein–RNA interactions for Protein: P01670

Ig kappa chain V-III region PC 6684, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01670 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01670 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01670 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01670 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01670 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01670 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01670 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01670 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01670 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01670 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01670 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01670 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01670 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01670 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01670 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01670 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01670 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01670 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01670 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01670 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01670 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01670 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01670 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01670 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01670 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01670 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01670 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01670 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01670 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01670 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01670 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P01670 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P01670 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01670 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01670 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01670 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01670 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01670 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01670 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P01670 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01670 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01670 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01670 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01670 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01670 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01670 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01670 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01670 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01670 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01670 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01670 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01670 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01670 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01670 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01670 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01670 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01670 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01670 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01670 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01670 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
P01670 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01670 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01670 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01670 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01670 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01670 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01670 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01670 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01670 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01670 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01670 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01670 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01670 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01670 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01670 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01670 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01670 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01670 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms