Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01649 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01649 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01649 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01649 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01649 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01649 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01649 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01649 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01649 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01649 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01649 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01649 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01649 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01649 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01649 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01649 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01649 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01649 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01649 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01649 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01649 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01649 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01649 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01649 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01649 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01649 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01649 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01649 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01649 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01649 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01649 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01649 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01649 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01649 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01649 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01649 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01649 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01649 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01649 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01649 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01649 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01649 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01649 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01649 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01649 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01649 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01649 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01649 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01649 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01649 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms