Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms