Protein–RNA interactions for Protein: O89113

Ier5, Immediate early response gene 5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ier5O89113 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ier5O89113 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ier5O89113 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ier5O89113 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ier5O89113 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ier5O89113 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ier5O89113 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ier5O89113 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ier5O89113 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ier5O89113 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ier5O89113 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ier5O89113 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms