Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Robo1O89026 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Robo1O89026 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Robo1O89026 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Robo1O89026 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Robo1O89026 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Robo1O89026 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Robo1O89026 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms