Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setdb1O88974 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms