Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcn2O88968 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms