Protein–RNA interactions for Protein: O88951

Lin7b, Protein lin-7 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin7bO88951 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms