Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MscO88940 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MscO88940 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MscO88940 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MscO88940 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MscO88940 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MscO88940 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MscO88940 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MscO88940 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MscO88940 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MscO88940 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MscO88940 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MscO88940 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MscO88940 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MscO88940 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MscO88940 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MscO88940 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MscO88940 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MscO88940 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MscO88940 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MscO88940 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MscO88940 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MscO88940 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MscO88940 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MscO88940 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MscO88940 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MscO88940 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MscO88940 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MscO88940 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MscO88940 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MscO88940 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MscO88940 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MscO88940 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MscO88940 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MscO88940 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MscO88940 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MscO88940 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MscO88940 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MscO88940 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MscO88940 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MscO88940 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MscO88940 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MscO88940 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MscO88940 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MscO88940 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MscO88940 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MscO88940 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MscO88940 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MscO88940 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MscO88940 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MscO88940 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MscO88940 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MscO88940 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MscO88940 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MscO88940 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MscO88940 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MscO88940 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MscO88940 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MscO88940 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MscO88940 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MscO88940 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MscO88940 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MscO88940 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MscO88940 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MscO88940 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MscO88940 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MscO88940 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MscO88940 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MscO88940 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MscO88940 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MscO88940 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MscO88940 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MscO88940 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MscO88940 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MscO88940 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MscO88940 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MscO88940 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MscO88940 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MscO88940 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms