Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mid1O70583 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1O70583 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1O70583 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1O70583 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1O70583 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1O70583 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1O70583 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1O70583 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid1O70583 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid1O70583 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mid1O70583 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms