Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad51dO55230 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms