Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChkbO55229 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChkbO55229 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChkbO55229 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChkbO55229 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChkbO55229 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChkbO55229 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChkbO55229 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChkbO55229 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChkbO55229 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChkbO55229 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChkbO55229 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChkbO55229 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms