Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms