Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TsksO54887 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TsksO54887 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TsksO54887 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TsksO54887 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TsksO54887 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TsksO54887 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TsksO54887 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TsksO54887 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TsksO54887 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TsksO54887 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TsksO54887 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TsksO54887 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TsksO54887 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TsksO54887 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TsksO54887 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TsksO54887 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TsksO54887 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TsksO54887 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TsksO54887 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TsksO54887 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TsksO54887 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TsksO54887 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TsksO54887 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TsksO54887 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TsksO54887 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TsksO54887 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TsksO54887 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TsksO54887 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TsksO54887 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TsksO54887 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TsksO54887 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TsksO54887 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TsksO54887 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TsksO54887 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TsksO54887 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TsksO54887 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TsksO54887 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TsksO54887 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TsksO54887 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TsksO54887 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TsksO54887 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TsksO54887 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TsksO54887 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TsksO54887 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TsksO54887 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TsksO54887 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TsksO54887 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TsksO54887 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TsksO54887 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TsksO54887 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TsksO54887 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsksO54887 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsksO54887 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsksO54887 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsksO54887 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsksO54887 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TsksO54887 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsksO54887 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TsksO54887 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsksO54887 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsksO54887 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsksO54887 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsksO54887 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsksO54887 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsksO54887 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TsksO54887 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TsksO54887 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TsksO54887 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TsksO54887 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TsksO54887 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TsksO54887 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TsksO54887 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TsksO54887 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TsksO54887 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TsksO54887 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TsksO54887 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TsksO54887 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TsksO54887 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TsksO54887 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TsksO54887 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TsksO54887 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TsksO54887 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TsksO54887 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TsksO54887 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TsksO54887 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TsksO54887 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TsksO54887 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TsksO54887 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TsksO54887 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TsksO54887 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TsksO54887 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TsksO54887 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TsksO54887 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TsksO54887 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TsksO54887 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TsksO54887 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TsksO54887 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TsksO54887 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TsksO54887 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms