Protein–RNA interactions for Protein: O54709

Klrk1, NKG2-D type II integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrk1O54709 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klrk1O54709 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms