Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr6O54689 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms