Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Polr1aO35134 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr1aO35134 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms