Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncoa3O09000 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncoa3O09000 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Ncoa3O09000 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncoa3O09000 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ncoa3O09000 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncoa3O09000 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms