Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms