Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U5

Vmn2r78, Vomeronasal 2, receptor 78, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r78K7N6U5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r78K7N6U5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r78K7N6U5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r78K7N6U5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r78K7N6U5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r78K7N6U5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r78K7N6U5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r78K7N6U5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r78K7N6U5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r78K7N6U5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r78K7N6U5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r78K7N6U5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r78K7N6U5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r78K7N6U5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r78K7N6U5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r78K7N6U5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r78K7N6U5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r78K7N6U5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms