Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21976J3QNN2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms